常用的基础CY荧光染料有哪些？各自是什么颜色的？

　　Cy3花氰染料

　　CAS号:1284240-77-2

　　

　　Cy3 (Cyanine 3) 是一种发橘黄色荧光的花青素荧光染料。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，Cy3的背景荧光一般认为比TAMRA等TRITC系列的染料低。 Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽等，它*常见的使用是标记核酸分子(DNA和RNA)。

　　Cy3一般偏脂溶性，较难溶于水，水相标记需有机溶剂共溶。磺化Cy3水溶性好，并且亮度更高，荧光稳定性也提高。

　　Cy3.5花氰染料

　　CAS号:1284240-77-2

　　分子式:C39H42N2O14S4

　　分子量:891.02

　　

　　磺化Cy3.5(sulfo-Cy3.5)标记分子，可在水相中标记各种官能团，适用于标记对有机溶剂敏感的生物分子

　　Cy5花氰染料

　　CAS号:146368-15-2

　　分子式:C45H52N4O14S2

　　分子量:937.04278

　　

　　Cy5是明亮的红色荧光染料。由于它的激发和发射峰都在长波长红光区，而在这个区域生物样品的自身荧光较弱，因此，相对于Cy3，Cy5具有明显的灵敏度优势。另外，它的荧光(ex：667nm)处在大多数仪器的检测范围内，所以它也是非常常见的荧光标记化合物。需要注意的是对像Cy5这样的长波长荧光，肉眼不是很敏感，荧光显微镜目镜一般不可见，除非强标记的样品。

　　花氰染料Cy5.5

　　CAS号:210892-23-2

　　

　　Cy5.5的发射光谱略大于700nm，处于红光/近红外交界区，它也恰好处于**个体内成像窗口(in vivo imaging window 1)边缘，可用于小动物体内成像。另外由于红外区生物样品包括组织的背景荧光很弱，它也常常适用于对背景荧光较忌讳的实验。

　　花氰染料Cy7

　　CAS号:943298-08-6

　　

　　Cy7 属近红外荧光染料，它发射的荧光肉眼不可见但是可以被大多数荧光仪器识别。它是非常常用的小动物成像染料，常常用来标记核酸，蛋白，多肽，纳米粒，多聚物等。由于它的发射波长比Cy5.5长，Cy7在小动物成像实验中一般比Cy5.5更灵敏，背景更弱。

　　花氰染料Cy7.5

　　CAS号:847180-48-7

　　分子式:C43H46N2O14S4

　　分子量:943.08

　　

　　Cy7.5是和ICG(Indocyanine green)类似的近红外荧光染料。它的荧光波长非常长，处于**个体内成像窗口(in vivo imaging window 1)的前半段，处于该区域的荧光染料在体内成像中*灵敏。荧光穿透强，背景低，常常用于小动物体内分布追踪等体内成像实验。

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